Действия картины разворачиваются в мире, который контролируют биоинженерные корпорации. Их сверхзадача - синергия компьютера и человека: «чипизация» неблагонадежных, прошивка мозга для тотального контроля над обществом. Привлекательная идея научного прогресса незаметно для гуманистов выродилась в манию кибернетической тирании. На фоне этой глобальной болезни человечества высвечивается трагическая судьба отдельного человека, подминаемого системой, но не теряющего надежды на свободу и счастье. Главного героя «Прошивки» Люка Гибсона лишили прошлого, перепрошив его сознание с помощью биокомпьютерного имплантата. Теперь Люк борется за свое будущее, узнав истинные мотивы ученых.